Skip to content

Genotipizacija bakterija iz roda Legionella pomoću metode PFGE donosi pravu sliku o izvoru i epidemiji


Donosimo prilog/komentar povodom medijskih vijesti o pojavi legionele u najvećoj hrvatskoj bolnici, i prilog istrazi odakle je zaraza krenula, je li to iz klima uređaja ili iz vodovoda bolnice, jesu li svi pacijenti koji su zaraženi infekciju dobili na odjelu ili je netko prijenosnik izvanbolnički te može li se ovaj slučaj proglasiti epidemijom

Mr. sc. Stjepan Katić

Za rješenje ovoga problema i otkrivanje putova prijenosa infekcije legionelom neophodno je primjeniti molekularnu genotipizaciju izoliranih i identificiranih sojeva Legionella pneumophila i to primjenom metode elektroforeze u pulsirajućem polju za genotipizaciju uzročnika bolničkih infekcija (PFGE – pulsed field gel elektroforeza)

Genotipizacija bakterija iz roda Legionella (Legionella pneumophila) pomoću metode elektroforeze u pulsirajućem polju (PFGE – pulsed field gel elektroforeza) može dati jasnu sliku o spoznaji izvora legioneloze te povezanosti s oboljelim pacijentima kao i za proglašenje eventualne epidemije. Jedino uključivanjem jedne ovakve genotipizacijske metode možemo očekivati zadovoljavajuće rezultate i dobiti jasne spoznaje koje nas zanimaju o nemilom događaju. Metoda je poznata i kao „fingerprinting“ te kao „zlatni standard“, s kojom sam sudjelovao u pomoći pri izradi više desetina doktorata i još više desetina znanstvenih CC radova. U svom magistarskom radu detaljno sam opisao genotipizacijsku molekularnu metodu PFGE i molekularnu analizu dobivenih tipova sojeva koji su prouzročili različite bolničke infekcije.

Bakterije iz roda Legionella su gram-negativne patogene bakterije koje uključuje vrstu Legionella pneumophila, koja je uzročnik legioneloze (bolesti uzrokovane legionelom) uključujući bolest tipa upale pluća naziva legionarska bolest i blagu bolest sličnu gripi naziva Pontiac groznica. To su bakterije koje su prisutna u tlu i slatkoj vodi, ali mogu kontaminirati i vodene sustave. Repliciraju se između 25 i 42°C, preživljavajući na višim temperaturama. Infekcija se dobiva udisanjem, aspiracijom ili mikroaspiracijom aerosola koji nosi legionele. Kapljice koje nose patogene mogu nastati prskanjem vode ili sa zrakom kroz kontaminiranu vodu. Imunokompromitacija, kronične bolesti i starost su predisponirajući čimbenici za razvoj bolesti. Legionella pneumophila serogrupa 1 je vrsta koja se najčešće povezuje s bolešću. Podatak za Italiju je od prijavljenih slučajeva 5,3% su infekcije stečena u bolnici, dok su 78,5% bile izvanbolničke stečene infekcije legionelom.

Sama metoda genotipizacije PFGE traje 5 dana, to je kompleksna metoda, ali dobiveli rezultati su vrlo korisni i praktično neophodni u ovom slučaju. Opisao sam univerzalni postupak genotipizacije pomoću metode u pulsirajućem polju kako gram-pozitivnih tako i gram-negativnih bakterija koje uzrokuju bolničke infekcije. Modificiranim postupkom genotipizacija je pojednostavljena, a omogućeno je i ranije otkrivanje prijenosnika infekcije i sprječavanje epidemije bolničke infekcije. Otkriveno je širenje bolničke infekcije prijenosom istog PFGE genotipa unutar pojedinih bolničkih odjela različitih gram-negativnih bakterija.

Literatura:

Katić, Stjepan
Primjena elektroforeze u pulsirajućem polju za genotipizaciju uzročnika bolničkih infekcija, 2004., magistarski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb. Ustanove: Institut “Ruđer Bošković”, Zagreb; Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb; Klinički bolnički centar Zagreb

Batarilo, Ivanka; Maravić-Vlahoviček, Gordana; Bedenić, Branka; Kazazić, Snježana; Bingulac-Popović, Jasna; Slade-Vitković, Mia; Katić, Stjepan; Jukić, Irena
Oxacillinases and antimicrobial susceptibility of Ralstonia pickettii from pharmaceutical water systems in Croatia // Letters in applied microbiology, 75 (2022), 1; 103-113 doi:10.1111/lam.13711 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Ladavac, Ranko; Bedenić, Branka; Vranić- Ladavac, Mirna; Barišić, Nada; Karčić; Pompe, Natalie Karoline; Ferenčić, Antun; Stojanović, Aleksandar; Seifert, Harald; Katić, Stjepan; Higgins, Paul G.
Emergence of different Acinetobacter baumannii clones in a Croatian hospital and correlation with antibiotic susceptibility // Journal of global antimicrobial resistance, 10 (2017), 213-218 doi:10.1016/j.jgar.2017.07.001 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, znanstveni)

Raka, Lul; Kalenic, Smilja; Bošnjak, Zrinka; Budimir, Ana; Katic, Stjepan; Šijak, Dubravko; Mulliqi-Osmani, Gjyle; Zoutman, Dick; Jaka, Arbëresha
Molecular Epidemiology of Acinetobacter baumannii in Central Intensive Care Unit in Kosova Teaching Hospital // The Brazilian Journal of Infectious Diseases, 13 (2009), 6; 416-419 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Raka, Lul; Kalenic, Smilja; Bošnjak, Zrinka; Budimir, Ana; Katic, Stjepan; Šijak, Dubravko; Mulliqi-Osmani, Gjyle; Zoutman, Dick; Jaka, Arbëresha
Molecular Epidemiology of Acinetobacter baumannii in Central Intensive Care Unit in Kosova Teaching Hospital // The Brazilian Journal of Infectious Diseases, 13 (2009), 6; 416-421 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Goić-Barišić, Ivana; Bedenić, Branka; Tonkić, Marija; Novak, Anita; Katić, Stjepan; Kalenić, Smilja; Punda-Polić, Volga; Towner, Kevin
Occurence of OXA-107 and Isaba1 in carbapenen-resistant isolates of Acinetobacter bauannii from Croatia // Journal of clinical microbiology, 47 (2009), 10; 3348-3349 doi:10.1128/JCM.02394-08 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni

Vraneš, Jasmina; Marijan, Tatjana; Bedenić, Branka; Mlinarić-Džepina, Ana; Katić, Stjepan; Kalenić, Smilja
Clonal Dissemination of Highly Virulent Extended-Spectrum Beta Lactamase-Producing Escherichia coli Strains Isolated From the Urine of Non-Hospitalised Patients in Zagreb Region // International Journal of Antimicrobial Agents, 31 (2008), Supplement 1; 19-24 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Goić Barišić, Ivana; Bedenic, Branka; Tonkić, Marija; Katić Stjepan; Novak, Anita; Kalenic, Smilja; Punda Polić, Volga
Molecular epidemiology of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in a university hospital, Split, Croatia // Clinical Microbiology and Infection / Towner, Kevin (ur.).
München, Njemačka: blackwell, 2007. str. S370-S370 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

Goić-Barišić, Ivana; Bedenić, Branka; Tonkić, Marija; Katić, Stjepan; Kalenić, Smilja; Punda-Polić, Volga
First Report of Molecular Characterization of Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii in Different Intensive Care Units in University Hospital Split, Croatia // Journal of Chemotherapy, 19 (2007), 4; 462-464 doi:10.1179/joc.2007.19.4.462 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Goić-Barišić, Ivana; Bedenić, Branka; Tonkić, Marija; Katić, Stjepan; Novak, Anita; Kalenić, Smilja
Molecular epidemiology of carbapenem resistant Acinetobacter baumannii in University Hospital Split, Croatia // Clinical Microbiology and Infection / Kewin Towner (ur.).
München, Njemačka: Wiley-Blackwell, 2007. (poster, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)

Tonkić, Marija; Bedenić, Branka; Goić-Barišić, Ivana; Katić, Stjepan; Kalenić, Smilja; Kaufmann, Mary; Woodford, Neil; Punda-Polić, Volga
First report of CTX-M-extended-spectrum beta-lactamase- producing isolates from Croatia // Journal of Chemotherapy, 19 (2007), 1; 97-100 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Marijan, Tatjana; Vranes, Jasmina; Bedenic, Branka; Katic, Stjepan; Mlinaric-Džepina, Ana; Plecko, Vanda; Kalenic, Smilja
Clonal dissemination of ESBLs-producing Escherichia coli strains in outpatient population in Zagreb region // International Journal of Infectious Diseases, 10 (2006), Suppl 1. (podatak o recenziji nije dostupan, kongresno priopcenje, znanstveni)

Bedenić, Branka; Schmidt, H.; Herold, S.; Monaco, M.; Plečko, Vanda; Kalenić, Smilja; Katić, Stjepan; Škrlin-Šubić, Jasenka
Epidemic and endemic spread of Klebsiella pneumoniae producing SHV-5 beta-lactamase in Dubrava University Hospital // Journal of chemotherapy, 17 (2005), 4; 367-375 doi:10.1179/joc.2005.17.4.367 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Bedenić, Branka; Schmidt, Herbert; Herold, Sylvia; Monaco, Monica; Plečko, Vanda; Kalenić, Smilja; Katić, Stjepan;
Persistence of Klebsiella Pneumoniae Producing SHV-5 beta-Lactamase in University Hospital, Zagreb. // Book of Abstracts of the World Conference on dosing of Antiinfectives. Paul Ehrlich Symposium.
Nürnberg, 2004. (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

Horvatić, Jasminka; Plečko, Vanda; Katić, Stjepan; Marijan, Sanja; Kalenić, Smilja
Utjecaj rezultata PFGE tipizacije na prekid MRSA epidemije na vaskularnoj kirurgiji // Fifth International Conference of the Hospital Infection Society, Book of Abstracts
Edinburgh, 2002. (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

Kalenić, Smilja; Plečko Vanda; Rebrović, Božica; Katić, Stjepan; Tripković, Vesna, Marinić-Pivac, Andreja
Sensitivity of Gram-positive Cocci in Hospitalized Patients // Abstract book, ICMAS 5 / ICMAS (ur.
Sevilla: ICMAS, 2000. (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

Optimized by Optimole